Seize ans ont passé depuis le terrible drame survenu dans le tokyo spacetree. arata est devenu éminent chercheur au sein de l'université des colonies unies. son objectif est clair : venir en aide aux daphnéens pour allonger leur espérance de vie... aveuglé par ses recherches, il ne voit pas que tara s'impatiente et ne rêve que d'une chose : passer un nouveau contrat avec lui.